Το ΓΧΚ συμμετέχει στο Γ΄ Κ.Π.Σ. με 3 έργα:

1. Έλεγχος ποιότητας υδάτων ως φορέας υλοποίησης, χρηματοδότησης και λειτουργίας.
Προϋπολογισμός : 3.810.000 ευρώ
Το έργο συμβασιοποιήθηκε και βρίσκεται στη φάση της επιχειρησιακής ολοκλήρωσης.

2. Ολοκληρωμένο Πληροφοριακό σύστημα Γ.Χ.Κ. ως φορέας λειτουργίας με φορέα υλοποίησης την Γ.Γ.Π.Σ. και φορέα χρηματοδότησης το Υπουργείο Οικονομικών.
Προϋπολογισμός : 950.000 ευρώ (Κοινωνία της Πληροφορίας)
Το έργο συμβασιοποιήθηκε και βρίσκεται στη φάση της επιχειρησιακής ολοκλήρωσης.

3. Δημιουργία Εργαστηρίου Χημικής Μετρολογίας, ως φορέας λειτουργίας με φορέα υλοποίησης το Ε.Ι.Μ. και χρηματοδότησης το Υπουργείο Ανάπτυξης.
Προϋπολογισμός : 1.500.000 ευρώ 
Το έργο συμβασιοποιήθηκε και βρίσκεται στη φάση της επιχειρησιακής ολοκλήρωσης.